安徽九华山旃檀林座落在九华街西南。清康熙年间 (1662 -1722年)为化城寺12寮房之一。光绪十二年(1886年)释定慧募化重建。1912年，住持僧福星扩建，居士易国干赠额“福慧双修”。住持僧镇安扩建殿宇，安单接众。1928-1949年莲禅、渡海、长升、蕴净、性朗先后任住持。1958一1977年为九华山佛教大队驻地。1982年重修。1978一1985年为九华山佛教协会驻地。全寺建筑面积2849平方米，1983年，被国务院确定为汉族地区佛教全国重点寺院。 旃檀禅林，全寺由四座厅堂式民居和宫殿式大雄宝殿组合而成。东为僧房和斋房，敞厅堂，3层楼阁，有内落水小天井。西为云水堂，敞厅4开间，2层楼，小天井。僧房和云水堂之间为前厅，内用板壁隔成弥勒殿和韦驮殿，进深20.5米，殿两侧是两层楼阁。
韦驮殿前有两个小雕像，一个是济颠和尚，一手拿着薄如纸的小酒盅，另一手摇关破芭蕉扇儿，笑盈盈，喜哈哈，手舞足蹈，似酒醉归来，逍遥自在。另一个是疯僧，赤足，手挥佛尘，左肋下夹着一把扫帚。据说，这是南宋风波和尚，他嫉恶如仇，痛恨害死岳飞的奸臣秦松，一心想扫灭秦贼，登着扫把，只要是人群集聚之地，即使很清洁，他也挥动扫帚扫地，说是“扫秦”(意扫清)，激发人们共同除奸。韦驮殿里，韦驮身着铠甲，手扶金刚杵，面对大雄宝殿佛像而立。
弥勒殿里供“西方三圣”，又称“阿弥陀三尊”，即西方极乐世界的教主、三世佛之一的阿弥陀佛，他有十三个名号，是净土宗的主要信仰对象。加上左边的观世音菩萨，右边的大抛至菩萨，合称为“西方三圣”。 从韦驮殿向左，进门又是一幢楼阁，楼上佛堂敞，楼下厅堂高大，古色古香。厅前天井狭长，左右为库房、僧寮。由韦驮殿向右，进角门穿过楼间小巷，是又一组楼堂。楼下三间敞厅，屏风后和左右两端有十间客房，楼前天井，上有巨幅壁画，为“墨龙行云图”，龙首向下喷水，鲤鱼向上跳跃，也称“鱼龙变休图”，左右上方还有“芦雁秋景”、“秋菊傲霜”和春兰、冬梅等小品图画。古雅清幽，可供观赏。
在两厢楼柱间，有唐玄奘率孙悟空、猪悟能、沙悟净西天取经的雕像，四人风尘仆仆，远道而来，各自伫立于廊下一角，好像等待寺中住持和尚出来迎接款待，十分有趣。
穿过一石板铺地，洁净如洗的长方形天井，就可达大雄宝殿。大雄宝殿高18米，宽11.5米，深15.5米。仰观大殿，铁黑色葫芦矗立在正脊中间，鱼龙尾翘在两边。重叠的飞檐，条条鱼龙飞来，装点得八角殿更加壮观。重檐间，绘着青狮彩凤。四周廊柱上，雕有“八仙”人物像：跛足蹒跚的铁拐李，腰间葫芦摇晃；风度翩翩的吕洞宾，潇洒自如，春风满面，袒胸露腹的汉钟离，须髯飘洒，手摇宝扇；倒骑毛驴的张果老，手击渔鼓，欲唱一曲“道情”；身穿官服的曹国舅也赶来檀板轻敲。还有仙人刘海，喜盈盈地在戏弄金蟾。这些都是道家神仙。殿前廊下左右钟鼓高悬，古钟重在千斤以上，镏金大字闪烁有光。廊下和佛幡前有黑底金字楹联和泥金雕花楹联。第一联曰：“山中作伴莫负烟霞，林下相逢祗谈因果”。又一联曰：“把臂入林可复有太白联吟阳明打坐，现身说法恍然悟新罗月满南海波澄。”说的是李白游九华，吟诗联句；王阳明上九华，在东崖晏坐，已为陈迹。所说“新罗”即金地藏，相传农历七月十五日是其生日，正值月满。“南海”指观音，普陀山为“南海观音道场”，与九华山齐名，都谓之“菩萨道场”。昔日佛教徒由于交通等条件限制，海外和内地朝山拜佛的善男信女到九华、普陀山的居多。作者兼顾了佛教和旅游，文字简明、雅俗共赏。佛像座前一联曰：“奉双亲参礼九华，喜今日旃檀林中便是极乐世界；愿一心长持半偈，想当年菩提树下用何等刻苦功夫。”这是出自在家信佛的居士之手，以示其虔诚。 殿堂正中供奉着释迦牟尼佛像，两旁侍立着是阿难、迦叶。两侧是观音、地藏像，观音像两侧有“金童”、“玉女”，地藏像两旁有闵公、道明侍立。大殿两侧依墙而塑的十八罗汉，与祗园寺的十八罗汉各有千秋，自台基以上至殿梁间，塑的是大海波涛，十八罗汉或立、或坐，或昏睡，或惊异，他们各异显神通，在惊涛骇浪里稳如泰山。鳌鱼、龙、鳖、虾、蟹、蚌之类水族都在他们脚下，为其效劳。水面上还有一只空荡荡的“法舟”，最高处还有佛龛、宝塔，仿佛是海上奇观。大殿中的佛像均用生漆夹纻法制成。一枝花茎能擎二、三丈的塑像。佛像制作工序较为复杂，预先雕刻好能分能合的木质佛像模型，拼合成一整体，外缠纻麻布，涂上生漆、铁砂调和的涂料，如此重复九至十三次。雏型制成后，将模型一块一块抽出来，然后刮净磨光，贴上赤金制成的“金箔”，金光闪闪的佛像就制成了。它具有防潮、防腐、防蚁蚀等优点，适宜于雨水多、云雾浓、湿度大的江南山区。九华佛寺中，这种造像较多。
大殿两侧是花厅，两层楼，有花院，名“山中天”。墙下依地势砌成花圃，种花植草。旁有山泉一眼，用石条砌成一方池，清澈见底，晶莹如镜。院落窄长，因花厅前檐高三丈，走廊宽六尺多，长五丈多，扩大了空间，所以视路开阔，是名副其实的“山中天”。花厅五间，中间二开间为敞厅，两端和屏风后有房间，与二楼、三楼共有十六间卧室，为接待贵宾下榻之处。敞厅装有玻璃隔扇，雕刻着各种神话故事。闲坐厅堂，便可欣赏神光岭、芙蓉峰上方木苍翠，白云袅袅，群鸟飞翔的景色，悦目清心，实为福地洞天。
旃檀林历史上最重大的重修有三次，第一次是1886年定禅法师重修大雄宝殿；第二次是1992年重建大悲殿；第三次是1998年新建大愿宝殿。该寺传承法系为临济宗。 旃檀禅林现任住持慧深法师，58岁，安徽六安人，1962年出家，师从仁德法师，毕业于南京楼霞佛学院，兼任安徽省九华山佛教协会副会长，贵池市政协常委。现任监院果禅法师，38岁。
1992年12月，旃檀禅林当家住持慧深和尚筹资修建的大悲楼举行了奠基仪式。该楼位于旃檀禅林左侧，建筑面积577平方米，古典砖木结构，殿中供奉千手千眼观音菩萨像，像高6.19米。楼上四面安置84尊小观音像，慈祥端庄。
